La Basilica di San Luigi fu costruita dai Gesuiti nel 168, nello stesso periodo del vicino collegio dei Gesuiti, per la beatificazione di Luigi Gonzaga, fratello dell’allora governante Francesco; divenne Basilica nel 1964 per opera di Papa Paolo VI.
Il disegno iniziale era del gesuita Luca Bienni di Salò mentre, quando furono ripresi i lavori dopo una lunga pausa, venne ricostruito il presbiterio su progetto di Paolo Soratino di Lonato, venne poi elevata la cupola e posto il nuovo altare in marmo con la pala di San Luigi di Antonio Balestra e, all’interno di questo è riposta la reliquia di San Luigi dal 1679. Di pregio un organo costruito da Gerolamo Bonatti di Desenzano datato 1794.